Obor: Speciální zootechnika – XADPS
Katedra speciální zootechniky
Forma studia: Prezenční, nebo kombinované
Školitel: doc. Ing. Luděk Stádník, Ph.D.
Školitel specialista: prom. biol. Karel Novák, CSc.
Vědecká hypotéza:
- Variabilita genů přirozené imunity v produkčních plemenech HZ ovlivňuje infekční odolnost na úrovni organismu a proto je využitelná pro tlumení infekcí.
- Populační hodnocení genů přirozené imunity lze v jednotlivých případech nahradit laboratorními testy.
Anotace:
Přirozená (vrozená) imunita využívá receptory a signální dráhy, které rozpoznávají bakteriální, virové, houbové a parazitární struktury. Zárukou funkce příslušných genů na populační úrovni je jejich dostatečná přirozená variabilita. V rámci disertační práce by měl být zmapován polymorfismus vybraných genů přirozené imunity u plemene či skupiny plemen skotu, resp. u jiného zvoleného druhu HZ. Následně by mělo proběhnout vyhodnocení funkčních dopadů nalezených strukturních odchylek na funkci genových produktů. Postupy by měly zahrnovat jak bioinformatické výpočetní metody, tak i laboratorní hodnocení. Výskyt jednotlivých strukturních variant by měl být souběžně korelován se statistickými údaji o zdravotním stavu na populační úrovni. Předpokládané laboratorní metody by měly zahrnout všechny standardní postupy molekulární genetiky, mj. izolační postupy pro nukleové kyseliny, PCR amplifikaci, sekvenování, fragmentační analýzu a genotypovací metody. Cílem vývoje laboratorních postupů pro funkční hodnocení genových variant je snížení nároků na provádění populačních studií. Výsledkem bude vymezení přínosu této skupiny genů k infekční odolnosti u sledovaných kombinací hostitel – patogen.
Grant nebo výzkumný záměr, z něhož bude činnost dotována: dlouhodobý koncepční rozvoj organizace, pro mléčný skot NAZV Q16100489 (2016 – 2018).