Fyziologie výživy a jakost produkce je v současné podobě předmětem výzkumu ve VÚŽV od roku 2003. Hned od počátku jsme měli jedinečnou možnost aktivně se zapojit do zásadní rekonstrukce laboratoří a vybudování vivária a experimentálních stájí pro drůbež a králíky. Výzkum zahrnuje studium biochemických pochodů a výzkum mikrobiálního osídlení v trávicím traktu drůbeže a králíků. Při studiu mikrobioty trávicího traktu dáváme důraz na studium rezistence vůči antibiotikům, což je jeden z hlavních problémů současné mikrobiologie. V této souvislosti zkoumáme i zkříženou rezistenci antimikrobiálních látek přírodního charakteru s antibiotiky, které se používají k léčbě lidí. Výživa zvířat úzce souvisí s kvalitou produkce. Kvalitu produkce dáváme vždy do souvislosti se zdravím naší populace a také na vliv živočišné výroby na životní prostředí. V našem výzkumu se zaměřujeme na využití domácích zdrojů krmiv a na použití pokročilých analytických metod, z nichž řadu jsme sami vyvinuli. Naše výsledky, ověřené přímo v pokusech na zvířatech, které mají předpoklad pro použití v praxi, jsou uplatňovány při tvorbě receptur krmných směsí a předávány výrobcům. Komplexní výzkum výživy drůbeže a králíků, který probíhá ve VÚŽV, je jedinečný v rámci celé ČR. Dlouhodobě probíhá mezinárodní spolupráce s Kielanovským institutem živočišné fyziologie a výživy, Polské akademie věd, Jablonna a Oddělením veterinární medicíny a živočišné výroby Milánské univerzity. Podílíme se na výuce výživy zvířat na České zemědělské univerzitě v Praze, se kterou máme několik společných grantů.